28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6222 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6222  hypothetical protein  100 
 
 		 619 aa  1224    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.690917  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2381  hypothetical protein  48.68 
 
 		 584 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4347  hypothetical protein  48.43 
 
 		 675 aa  474  1e-132  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3910  hypothetical protein  46.38 
 
 		 673 aa  475  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3711  hypothetical protein  42.88 
 
 		 654 aa  448  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3473  hypothetical protein  45.93 
 
 		 638 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0929  hypothetical protein  44.18 
 
 		 692 aa  416  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0568347  normal  0.0205131 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02280  predicted dinucleotide-binding enzyme  40.31 
 
 		 867 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1050  hypothetical protein  36.45 
 
 		 618 aa  272  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.526264  normal  0.107352 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4373  hypothetical protein  30.03 
 
 		 633 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.32896e-21 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3018  hypothetical protein  33.44 
 
 		 603 aa  265  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0249937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0676  hypothetical protein  33.08 
 
 		 659 aa  226  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.758616  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0823  hypothetical protein  33.56 
 
 		 651 aa  223  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4655  hypothetical protein  44.13 
 
 		 770 aa  218  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134449  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17770  hypothetical protein  34.94 
 
 		 644 aa  211  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.413089  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2071  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 616 aa  200  6e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03600  hypothetical protein  31.55 
 
 		 651 aa  187  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1859  FAD(NAD)-dependent oxidoreductase  25.96 
 
 		 623 aa  186  1.0000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1458  putative lipoprotein  25.69 
 
 		 624 aa  161  4e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.342191  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11200  hypothetical protein  37.2 
 
 		 593 aa  138  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41800  hypothetical protein  25.8 
 
 		 615 aa  112  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2744  hypothetical protein  28.7 
 
 		 580 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0706789  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0617  hypothetical protein  27.03 
 
 		 624 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.108776  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2959  hypothetical protein  27.43 
 
 		 551 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0119375  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11418  hypothetical protein  23.05 
 
 		 580 aa  99.4  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1163  hypothetical protein  25.35 
 
 		 742 aa  87.4  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1205  hypothetical protein  26.38 
 
 		 593 aa  82.8  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4291  hypothetical protein  27.93 
 
 		 483 aa  48.9  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.814822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>