More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3578 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_02621  N-(5-amino-5-carboxypentanoyl)-L-cysteinyl-D- valine synthase (EC 6.3.2.26)(Delta-(L-alpha-aminoadipyl)-L-cysteinyl-D- valine synthetase)(ACV synthetase)(ACVS) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P27742]  28.07 
 
 
3770 aa  656    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.830211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  37.22 
 
 
3470 aa  1066    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4221  non-ribosomal peptide synthetase  36.8 
 
 
2174 aa  1112    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.206011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  37.58 
 
 
4317 aa  1095    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2338  peptide synthetase  26.03 
 
 
2387 aa  713    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  38.09 
 
 
5953 aa  1106    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  39.51 
 
 
6889 aa  1196    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.3 
 
 
2385 aa  905    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  36.51 
 
 
4336 aa  1104    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  29.76 
 
 
2138 aa  1038    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  37.03 
 
 
2151 aa  1127    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2829  non-ribosomal peptide synthetase SyfA  31.59 
 
 
3168 aa  706    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  34.88 
 
 
5929 aa  882    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  34.69 
 
 
4383 aa  844    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  35.97 
 
 
3432 aa  1130    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  35.91 
 
 
4531 aa  971    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.33 
 
 
2385 aa  911    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  38.32 
 
 
5328 aa  1165    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  31.42 
 
 
2385 aa  924    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  31.57 
 
 
2385 aa  924    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1643  putative peptide synthetase  35.45 
 
 
3328 aa  880    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1705  amino acid adenylation  33.24 
 
 
4186 aa  913    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.254367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  37.34 
 
 
3021 aa  859    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  37.03 
 
 
4336 aa  1105    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  36.88 
 
 
2154 aa  1126    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  35.09 
 
 
4468 aa  914    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  31.7 
 
 
3165 aa  708    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2577  amino acid adenylation  34.77 
 
 
5926 aa  910    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  36.97 
 
 
9498 aa  1101    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2614  amino acid adenylation  35.19 
 
 
5372 aa  912    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.797013 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2615  amino acid adenylation  31.44 
 
 
5469 aa  687    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.301045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  37.03 
 
 
13537 aa  1147    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  37.74 
 
 
6676 aa  1155    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1867  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  38.58 
 
 
3629 aa  899    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  31.71 
 
 
2867 aa  865    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  29.96 
 
 
2791 aa  845    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  37 
 
 
1142 aa  649    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  36.96 
 
 
3308 aa  1244    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  35.99 
 
 
3498 aa  1220    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  35.2 
 
 
3291 aa  1238    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  33.29 
 
 
3231 aa  642    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2086  putative siderophore related no-ribosomal peptide synthase  37.16 
 
 
3287 aa  755    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0873  putative non-ribosomal peptide synthetase  36.96 
 
 
3294 aa  754    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2161  hypothetical protein  35.38 
 
 
6274 aa  926    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0272  thiotemplate mechanism natural product synthetase  33.5 
 
 
4239 aa  788    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  35.67 
 
 
6072 aa  1040    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  35.12 
 
 
4572 aa  920    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  33.29 
 
 
3291 aa  858    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  37.07 
 
 
4502 aa  1136    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  32.2 
 
 
2136 aa  714    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  31.54 
 
 
5422 aa  699    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  38.08 
 
 
4882 aa  1079    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  38.03 
 
 
3002 aa  911    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  36.83 
 
 
4332 aa  1102    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  37.84 
 
 
3219 aa  726    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  36.38 
 
 
6081 aa  1056    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.33 
 
 
2385 aa  911    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  31.85 
 
 
4037 aa  778    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  38.45 
 
 
1138 aa  655    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  35.08 
 
 
1801 aa  739    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  32.03 
 
 
3650 aa  676    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2418  peptide synthetase-like protein  37.9 
 
 
3296 aa  763    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2450  amino acid adenylation  38.39 
 
 
4290 aa  994    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  40.11 
 
 
4489 aa  1055    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2460  amino acid adenylation  37.42 
 
 
2605 aa  865    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441641  normal  0.494441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2054  amino acid adenylation  36.26 
 
 
3102 aa  1013    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  36.76 
 
 
3180 aa  766    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2093  amino acid adenylation domain-containing protein  27.3 
 
 
2410 aa  739    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  32.21 
 
 
5467 aa  732    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  39.01 
 
 
2370 aa  1120    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  37.82 
 
 
3231 aa  723    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2090  amino acid adenylation domain-containing protein  28.26 
 
 
1568 aa  652    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3466  amino acid adenylation  34.56 
 
 
1745 aa  662    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1537  amino acid adenylation domain-containing protein  37.51 
 
 
3227 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  37.05 
 
 
3176 aa  872    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.173269 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2088  amino acid adenylation domain-containing protein  27.24 
 
 
2894 aa  838    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4420  amino acid adenylation domain-containing protein  39.42 
 
 
1726 aa  811    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.466879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  37.69 
 
 
4342 aa  1082    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  37.06 
 
 
5149 aa  963    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  39.17 
 
 
2189 aa  1224    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  38.85 
 
 
2448 aa  1186    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3098  amino acid adenylation domain-containing protein  36.39 
 
 
3524 aa  906    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  37.82 
 
 
3231 aa  723    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2095  amino acid adenylation domain-containing protein  29.35 
 
 
3395 aa  769    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.800691  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0546  amino acid adenylation domain-containing protein  32.26 
 
 
2151 aa  832    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3529  amino acid adenylation domain-containing protein  34.56 
 
 
1745 aa  662    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3845  amino acid adenylation domain-containing protein  33.81 
 
 
1721 aa  672    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.549835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3477  amino acid adenylation domain-containing protein  34.68 
 
 
1745 aa  670    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0634623  normal  0.144372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  34.87 
 
 
2187 aa  862    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1625  putative non-ribosomal peptide synthetase  36.89 
 
 
3297 aa  753    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0842979  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10861  hypothetical protein  30.11 
 
 
2199 aa  649    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1941  putative peptide synthetase  35.45 
 
 
3352 aa  880    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2025  putative syringomycin synthetase  35.38 
 
 
6272 aa  929    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0288  putative non-ribosomal peptide synthetase  36.96 
 
 
3294 aa  754    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  33.98 
 
 
3962 aa  875    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1927  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  37.29 
 
 
3290 aa  761    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2696  amino acid adenylation domain-containing protein  35.13 
 
 
1762 aa  671    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.502345  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2005  putative syringomycin synthetase  35.38 
 
 
6271 aa  924    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  35.65 
 
 
6006 aa  884    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1942  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  37.05 
 
 
3290 aa  754    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>