30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0014 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0014  putative septation inhibitor protein  100 
 
 
85 aa  170  6e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0057  hypothetical protein  48.24 
 
 
81 aa  77.8  5e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517765  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0059  protein of unknown function UPF0233  46.59 
 
 
85 aa  66.6  1e-10  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0032  protein of unknown function UPF0233  42.39 
 
 
90 aa  64.7  4e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.361268  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0021  protein of unknown function UPF0233  37.65 
 
 
81 aa  63.9  8e-10  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0131  hypothetical protein  41.11 
 
 
88 aa  63.2  1e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120533  normal  0.12601 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0107  hypothetical protein  41.86 
 
 
81 aa  63.2  1e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225893  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0166  protein of unknown function UPF0233  40.91 
 
 
87 aa  59.7  1e-08  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.577284 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5245  protein of unknown function UPF0233  36.78 
 
 
84 aa  58.9  2e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0646831  hitchhiker  0.0050054 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0043  putative septation inhibitor protein  34.48 
 
 
84 aa  57.4  7e-08  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0058  hypothetical protein  40 
 
 
87 aa  55.1  3e-07  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0020  protein of unknown function UPF0233  32.94 
 
 
83 aa  55.1  3e-07  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0053  hypothetical protein  36.67 
 
 
101 aa  52  3e-06  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.282222  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0016  putative septation inhibitor protein  34.44 
 
 
88 aa  51.2  4e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0016  protein of unknown function UPF0233  28.24 
 
 
83 aa  51.2  5e-06  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13441e-11 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0013  protein of unknown function UPF0233  34.38 
 
 
94 aa  50.4  8e-06  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4439  hypothetical protein  38.46 
 
 
87 aa  50.1  9e-06  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.105645  normal  0.316052 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0025  protein of unknown function UPF0233  31.17 
 
 
110 aa  49.7  1e-05  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.154771  normal  0.108685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0016  hypothetical protein  30.23 
 
 
84 aa  48.1  3e-05  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6132  hypothetical protein  37.78 
 
 
87 aa  47.8  5e-05  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00160  hypothetical protein  40.32 
 
 
87 aa  47.4  7e-05  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.160689  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00150  Uncharacteriszd protein family (UPF0233)  34.04 
 
 
89 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28114  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27040  Uncharacterised protein family (UPF0233)  40.54 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.596682  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00290  putative septation inhibitor protein  37.08 
 
 
87 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348658  normal  0.0596427 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0020  putative septation inhibitor protein  32.98 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0181383 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0012  putative septation inhibitor protein  32.98 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.395634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0012  putative septation inhibitor protein  32.98 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0025  protein of unknown function UPF0233  29.59 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.389435  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0019  putative septation inhibitor protein  32.29 
 
 
93 aa  41.2  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.860021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0815  putative septation inhibitor protein  32.29 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144897  normal  0.704435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>