32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0295 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0295  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  160  6e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.152807 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2071  ChaB  62.67 
 
 
74 aa  95.5  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2443  ChaB  63.77 
 
 
76 aa  93.6  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1848  ChaB family protein  61.64 
 
 
76 aa  92  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3607  ChaB  55.26 
 
 
76 aa  92  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0044472  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1369  cation transport regulator  57.33 
 
 
76 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.760537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1907  cation transport regulator  57.33 
 
 
76 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1965  cation transport regulator  57.33 
 
 
76 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.640932 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1901  cation transport regulator  57.33 
 
 
76 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.903539  normal  0.252452 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1553  cation transport regulator  56 
 
 
76 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.203336 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2429  ChaB family protein  53.95 
 
 
76 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.40977  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01205  hypothetical protein  53.95 
 
 
76 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1700  cation transport regulator  53.95 
 
 
76 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.692804  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1923  cation transport regulator  53.95 
 
 
76 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.41011  normal  0.0497517 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2406  cation transport regulator  53.95 
 
 
76 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000158278 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1325  cation transport regulator  53.95 
 
 
76 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.109112  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01195  cation transport regulator  53.95 
 
 
76 aa  87.8  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0461  putative cation transport regulato, ChaB  53.95 
 
 
76 aa  85.9  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0930  ChaB family protein  58.44 
 
 
82 aa  84.3  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.176376  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1384  cation transport regulator  53.95 
 
 
76 aa  79.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.886338  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1367  cation transport regulator  53.95 
 
 
76 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0817532  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2331  cation transport regulator  53.33 
 
 
76 aa  77  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.704866  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2785  ChaB  52 
 
 
68 aa  73.9  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.167104  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0323  putative cation transport regulator  64.71 
 
 
56 aa  68.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.262296 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0020  ChaB family protein  47.95 
 
 
68 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0379  ChaB family protein  44 
 
 
73 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.303727  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0349  ChaB  44 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0812  ChaB  40.79 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4814  ChaB family protein  36.11 
 
 
81 aa  52  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.442759  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3951  ChaB family protein  36.11 
 
 
82 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.385591  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0519  ChaB family protein  31.94 
 
 
81 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4919  ChaB  38.36 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0756604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>