18 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
Tgr7_0171  CDS  NC_011901  184786  187212  +  2427  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  YP_002512257  unclonable  0.0000289521  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_0502  CDS  NC_011901  536400  536819  +  420  Os01g0355500; hypothetical protein  YP_002512586  unclonable  0.000000243773  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_1948  CDS  NC_011901  2069293  2069892  -  600  hypothetical protein  YP_002514016  unclonable  0.000000187906  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2405  CDS  NC_011901  2550145  2551347  -  1203  tyrosyl-tRNA synthetase  YP_002514470  unclonable  0.00000233958  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2406  CDS  NC_011901  2551412  2552965  +  1554  Peptidase M23  YP_002514471  unclonable  0.00000297595  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2780  CDS  NC_011901  2921657  2922667  -  1011  hypothetical protein  YP_002514841  unclonable  0.000000960474  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2781  CDS  NC_011901  2923165  2924232  -  1068  hypothetical protein  YP_002514842  unclonable  0.000000711113  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2782  CDS  NC_011901  2924645  2924926  +  282  hypothetical protein  YP_002514843  unclonable  0.0000000931172  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2783  CDS  NC_011901  2924929  2925213  +  285  plasmid stabilization system  YP_002514844  unclonable  0.0000000825631  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2784  CDS  NC_011901  2925347  2926366  -  1020  putative porin  YP_002514845  unclonable  0.00000063685  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2785    NC_011901  2926922  2927364  +  443      unclonable  0.000000147768  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2786  CDS  NC_011901  2927410  2927730  +  321  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  YP_002514846  unclonable  0.000000094081  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2787  CDS  NC_011901  2928234  2928590  -  357  hypothetical protein  YP_002514847  unclonable  0.000000122053  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2788  CDS  NC_011901  2928656  2929048  -  393  ribosomal protein S9  YP_002514848  unclonable  0.000000140519  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2789  CDS  NC_011901  2929108  2929536  -  429  50S ribosomal protein L13  YP_002514849  unclonable  0.000000137696  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_2790  CDS  NC_011901  2930048  2930353  -  306  ferredoxin, 2Fe-2S  YP_002514850  unclonable  0.000000127071  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_3240  CDS  NC_011901  3387069  3387959  +  891  Phosphoribulokinase  YP_002515295  unclonable  0.000000913358  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Tgr7_R0045  tRNA  NC_011901  2928129  2928202  -  74  tRNA-Gln    unclonable  0.0000000500622  n/a    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>