33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Val-2 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  tRNA-Val-2  tRNA-Val  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.599636  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-3  tRNA-Val  91.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00184226  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1248  tRNA-Val  91.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.134542  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0046  tRNA-Val  91.23 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.461452  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-1  tRNA-Val  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_163  tRNA-Val  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0004  tRNA-Val  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0003  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0022  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0054  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0077  tRNA-Ala  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0063  tRNA-Val  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0011  tRNA-Val  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000197558  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0013  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.162323  normal  0.0743617 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0030  tRNA-Ala  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0023  tRNA-Ala  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00683735  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0034  tRNA-Ala  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0822071  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0052  tRNA-Ala  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00134949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0071  tRNA-Ala  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0061  tRNA-Ala  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0056  tRNA-Ala  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0020  tRNA-Ala  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0072  tRNA-Ala  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.821542  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0035  tRNA-Ala  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304574  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0076  tRNA-Ala  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.989277 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0020  tRNA-Ala  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.18478  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0062  tRNA-Ala  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.128618  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0007  tRNA-Ala  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291536 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0046  tRNA-Ala  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0017  tRNA-Ala  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0394632  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0023  tRNA-Ala  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0030  tRNA-Ala  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.284622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0083  tRNA-Ala  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>