27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0669 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0669  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  310  5.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3261  hypothetical protein  42.03 
 
 
147 aa  100  5e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3686  hypothetical protein  35.17 
 
 
157 aa  89  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.949579  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0083  hypothetical protein  35.37 
 
 
150 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3059  hypothetical protein  30.32 
 
 
163 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2978  hypothetical protein  34.81 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.115195  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0241  SMI1 / KNR4 family  34.81 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.13706e-82 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0191  hypothetical protein  31.58 
 
 
150 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00129931  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3292  SMI1 / KNR4 family  30.32 
 
 
163 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0711818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3040  hypothetical protein  27.03 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00301564  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3329  hypothetical protein  31.21 
 
 
150 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0225  hypothetical protein  27.89 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00791746  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0196  hypothetical protein  27.89 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015189  hitchhiker  9.216949999999999e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1950  SMI1 / KNR4 family  27.2 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.103275 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0811  hypothetical protein  32.76 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00070518  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3286  SMI1 / KNR4 family  27.59 
 
 
162 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0366104  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1495  hypothetical protein  28.08 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2990  hypothetical protein  30.17 
 
 
150 aa  52  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4305  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4-like protein  29.93 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3885  hypothetical protein  27.63 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3480  hypothetical protein  35.23 
 
 
210 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.338589  normal  0.195106 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0971  hypothetical protein  27.97 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1960  hypothetical protein  28.06 
 
 
140 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.186824  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0463  hypothetical protein  45.65 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000438987  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4290  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4-like protein  38.18 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.582058  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1159  hypothetical protein  24.83 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.652307  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2458  hypothetical protein  50 
 
 
179 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.96206  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>