22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3686 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3686  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  324  3e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.949579  normal  0.0504873 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3261  hypothetical protein  38.56 
 
 
147 aa  97.8  6e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0669  hypothetical protein  35.17 
 
 
150 aa  89  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3059  hypothetical protein  30.32 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000812315  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0083  hypothetical protein  27.4 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3292  SMI1 / KNR4 family  31.25 
 
 
163 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0711818  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1495  hypothetical protein  24.66 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3286  SMI1 / KNR4 family  23.72 
 
 
162 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0366104  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0440  hypothetical protein  28.39 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000072769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2978  hypothetical protein  26.21 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.115195  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0241  SMI1 / KNR4 family  26.21 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.13706e-82 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3040  hypothetical protein  27.63 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00301564  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3329  hypothetical protein  30.82 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0187  hypothetical protein  25 
 
 
336 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0191  hypothetical protein  24.31 
 
 
150 aa  47.8  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00129931  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2458  hypothetical protein  28.02 
 
 
179 aa  47  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.96206  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0196  hypothetical protein  22.92 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015189  hitchhiker  9.216949999999999e-43 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0225  hypothetical protein  22.92 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00791746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1950  SMI1 / KNR4 family  28.36 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.103275 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1159  hypothetical protein  29.09 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.652307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0811  hypothetical protein  25 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00070518  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3072  hypothetical protein  28.48 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000118207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>