16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0536 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0597  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  212  9.999999999999999e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.733421  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0536  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  211  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1060  hypothetical protein  98.33 
 
 		 60 aa  116  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0954839 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0242  hypothetical protein  50 
 
 		 90 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0196  hypothetical protein  45.59 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0645997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2194  hypothetical protein  40.79 
 
 		 93 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2118  hypothetical protein  43.66 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3976  hypothetical protein  39.73 
 
 		 94 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425175  normal  0.0185965 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4111  hypothetical protein  34.09 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0515826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1057  hypothetical protein  35.71 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0342986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3648  hypothetical protein  34.52 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0542195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4719  hypothetical protein  34.52 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5581  hypothetical protein  35.71 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4576  hypothetical protein  36.47 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616061  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4509  hypothetical protein  39.39 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0457515 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4351  hypothetical protein  41.1 
 
 		 87 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>