16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4509 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4509  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  199  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0457515 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4351  hypothetical protein  73.26 
 
 		 87 aa  124  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4111  hypothetical protein  60.64 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0515826 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4576  hypothetical protein  60.64 
 
 		 97 aa  101  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616061  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5581  hypothetical protein  60.64 
 
 		 97 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1057  hypothetical protein  59.57 
 
 		 97 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0342986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3648  hypothetical protein  59.57 
 
 		 97 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0542195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4719  hypothetical protein  59.57 
 
 		 97 aa  98.6  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3976  hypothetical protein  61.9 
 
 		 94 aa  94.7  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425175  normal  0.0185965 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2118  hypothetical protein  38.78 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2194  hypothetical protein  43.24 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0242  hypothetical protein  43.24 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0536  hypothetical protein  39.39 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0597  hypothetical protein  39.39 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.733421  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6553  hypothetical protein  38.36 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.801985 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0196  hypothetical protein  34.25 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0645997  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>