16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4576 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4576  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  184  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.616061  hitchhiker  0.00000690458 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4111  hypothetical protein  98.97 
 
 
128 aa  182  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0515826 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5581  hypothetical protein  95.88 
 
 
97 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432685 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3648  hypothetical protein  94.85 
 
 
97 aa  176  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0542195  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4719  hypothetical protein  94.85 
 
 
97 aa  176  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0410363 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1057  hypothetical protein  93.81 
 
 
97 aa  176  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0342986  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3976  hypothetical protein  83.51 
 
 
94 aa  156  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425175  normal  0.0185965 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4509  hypothetical protein  60.64 
 
 
102 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0457515 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4351  hypothetical protein  59.52 
 
 
87 aa  92.8  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2194  hypothetical protein  51.95 
 
 
93 aa  82  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2118  hypothetical protein  42.42 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0242  hypothetical protein  41.3 
 
 
90 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0536  hypothetical protein  36.47 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0597  hypothetical protein  36.47 
 
 
111 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.733421  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0196  hypothetical protein  32.56 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0645997  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1060  hypothetical protein  37.25 
 
 
60 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0954839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>