299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2681 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_4220  tRNA-Asp  100 
 
 		 79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.579295  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2681  tRNA-Asp  100 
 
 		 79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0214101 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0006  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0035  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.527919  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0057  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0036  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.321878  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0014  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0090  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0056  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0019  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000139043  normal  0.566857 
 
 
-
 
NC_003295  RS02887  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.691799  normal  0.0580057 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0247  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.232166  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3492  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 79 bp  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.140765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2099  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000679661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1946  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3214  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000106519  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0019  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0460916  hitchhiker  0.000581212 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0056  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172836  normal  0.350992 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asp-3  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0247  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Asp-4  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000234173  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2536  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0232654  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1221  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0034  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000139644  normal  0.214126 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0030  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372782  normal  0.435881 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2713  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000225937  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0023  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.407669  normal  0.337177 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3358  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0487179  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2471  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2621  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000284605  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2623  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000119328  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2806  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.132763  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1987  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000448735  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1989  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000700104  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2128  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.295642  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2484  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  unclonable  0.000000000000127815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2351  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538678  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0049  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2324  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0054  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000254404  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1372  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173514  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2538  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00838842  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0032  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000015276  normal  0.216966 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0030  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000504867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2455  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0094  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000513172  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0098  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000169321  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0101  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0037  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.749982  normal  0.314117 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0056  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176781  normal  0.237793 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0049  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.203768  normal  0.0133799 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0052  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000050358  normal  0.257464 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0016  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000000350456  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0046  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000184395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0056  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338252  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0047  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0050  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744732  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2482  tRNA-Asp  98.65 
 
 		 77 bp  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000381628  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0037  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451566  normal  0.215433 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t031  tRNA-Asp  97.33 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60500  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  133  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0056  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299906 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60440  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  133  6.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t27  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.198832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t44  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.102861  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t45  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0281259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t46  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00513183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0085  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.150257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0059  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0311409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2041  tRNA-Asp  100 
 
 		 79 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0036  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227491  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t086  tRNA-Asp  97.33 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000212275 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t46  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t47  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t49  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA27  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.237638  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA29  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000082024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0037  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R26  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000223241  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R28  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771602  normal  0.0209843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R37  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R38  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.809466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0057  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0060  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000184808  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0064  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000566491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t020  tRNA-Asp  97.33 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000245604 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0021  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0060  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0314851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0066  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2040  tRNA-Asp  100 
 
 		 79 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0039  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0055  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297696 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0054  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0019  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0178689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0021  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0103753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0038  tRNA-Asp  100 
 
 		 77 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352364  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1860  tRNA-Asp  100 
 
 		 79 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000224596  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21810  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000145079  normal  0.0686942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24120  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000157836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24130  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000273209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41200  tRNA-Asp  100 
 
 		 74 bp  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.259841  normal  0.399457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>