11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1027 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1027  VirK protein  100 
 
 		 145 aa  295  2e-79  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.242513  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0903  VirK family protein  97.93 
 
 		 145 aa  266  5e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.927104  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03361  VirK  37.93 
 
 		 143 aa  106  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194089  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2875  VirK family protein  39.32 
 
 		 143 aa  88.2  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1194  VirK family protein  37.29 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1391  VirK family protein  34.48 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2285  putative signal peptide protein  37.96 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2879  VirK  36.21 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149986  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2998  hypothetical protein  35.96 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148355  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0980  hypothetical protein  27.52 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263356  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0891  hypothetical protein  27.62 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>