15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2875 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2875  VirK family protein  100 
 
 		 143 aa  295  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1194  VirK family protein  85.31 
 
 		 143 aa  241  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03361  VirK  55.71 
 
 		 143 aa  174  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194089  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1391  VirK family protein  50.34 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2998  hypothetical protein  45.45 
 
 		 142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148355  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2879  VirK  42.96 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149986  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2285  putative signal peptide protein  42.64 
 
 		 143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1027  VirK protein  39.32 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.242513  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0903  VirK family protein  36.55 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.927104  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1256  hypothetical protein  36.27 
 
 		 104 aa  80.9  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0891  hypothetical protein  28.97 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0980  hypothetical protein  29.66 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263356  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1795  hypothetical protein  25.6 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1796  hypothetical protein  24.8 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2196  hypothetical protein  26.97 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00124751  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>