36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1119 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1119  outer membrane lipoprotein Slp  100 
 
 
107 aa  216  7.999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02439  outer membrane protein Slp  76.34 
 
 
166 aa  152  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0861  outer membrane lipoprotein Slp  67.68 
 
 
175 aa  139  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1956  outer membrane lipoprotein Slp  45.83 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202475  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2316  outer membrane lipoprotein Slp, putative  45.83 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.884572  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2420  outer membrane lipoprotein Slp  37.96 
 
 
181 aa  68.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.736746  normal  0.0108754 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2348  outer membrane lipoprotein, Slp family  34.71 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0667  outer membrane lipoprotein, Slp family  40.26 
 
 
185 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1325  Outer membrane lipoprotein Slp  41.33 
 
 
171 aa  60.8  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2260  Slp family outer membrane lipoprotein  37.11 
 
 
181 aa  57.4  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.349564  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2806  Slp family outer membrane lipoprotein  32.98 
 
 
198 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0323453  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2173  Slp family outer membrane lipoprotein  33.64 
 
 
189 aa  54.3  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2347  outer membrane lipoprotein Slp  39.13 
 
 
155 aa  53.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.831306  normal  0.890388 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0908  outer membrane lipoprotein, Slp family  30.26 
 
 
185 aa  51.2  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2419  outer membrane lipoprotein Slp  35.23 
 
 
166 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0101966 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004092  starvation lipoprotein Slp like protein  32.53 
 
 
185 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1817  Slp family outer membrane lipoprotein  38.89 
 
 
189 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42187  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2184  Slp family outer membrane lipoprotein  32.89 
 
 
204 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1572  putative outer membrane lipoprotein Slp  32.58 
 
 
202 aa  48.9  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178723  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2172  outer membrane lipoprotein Slp  36.84 
 
 
177 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01377  hypothetical protein  36.05 
 
 
185 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01135  Starvation-inducible outer membrane lipoprotein  38.57 
 
 
218 aa  46.6  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2207  outer membrane lipoprotein Slp  30.48 
 
 
183 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0543  Slp family outer membrane lipoprotein  32.86 
 
 
165 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2761  Slp family outer membrane lipoprotein  31.46 
 
 
196 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000231326  hitchhiker  0.00115108 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1619  Outer membrane lipoprotein Slp  37.33 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2404  Slp family outer membrane lipoprotein  33.7 
 
 
201 aa  41.6  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000394448  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1429  Outer membrane lipoprotein Slp  31.94 
 
 
190 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00755368  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2015  Slp family outer membrane lipoprotein  33.7 
 
 
195 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000421651  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2126  Slp family outer membrane lipoprotein  33.7 
 
 
201 aa  41.6  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2011  outer membrane lipoprotein, Slp family  31.68 
 
 
205 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.793199  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2376  Slp family outer membrane lipoprotein  33.7 
 
 
193 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1497  outer membrane protein Slp  33.7 
 
 
193 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443162  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1312  outer membrane protein Slp  33.7 
 
 
193 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0266673  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2020  outer membrane protein Slp  33.7 
 
 
193 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.251668  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1959  outer membrane protein Slp  33.7 
 
 
193 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.286575  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>