61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2420 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2420  outer membrane lipoprotein Slp  100 
 
 
181 aa  358  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.736746  normal  0.0108754 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2173  Slp family outer membrane lipoprotein  52 
 
 
189 aa  173  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0667  outer membrane lipoprotein, Slp family  57.06 
 
 
185 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1325  Outer membrane lipoprotein Slp  40.13 
 
 
171 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2348  outer membrane lipoprotein, Slp family  42.42 
 
 
190 aa  107  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1619  Outer membrane lipoprotein Slp  43.88 
 
 
167 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2316  outer membrane lipoprotein Slp, putative  35.06 
 
 
178 aa  98.6  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.884572  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1956  outer membrane lipoprotein Slp  35.06 
 
 
178 aa  98.6  4e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.202475  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02439  outer membrane protein Slp  39.24 
 
 
166 aa  98.6  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2806  Slp family outer membrane lipoprotein  37.72 
 
 
198 aa  97.8  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0323453  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2260  Slp family outer membrane lipoprotein  34.31 
 
 
181 aa  95.1  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.349564  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2207  outer membrane lipoprotein Slp  33.33 
 
 
183 aa  92  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004092  starvation lipoprotein Slp like protein  31.21 
 
 
185 aa  92  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0861  outer membrane lipoprotein Slp  33.73 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0668  outer membrane lipoprotein Slp  42.42 
 
 
165 aa  88.6  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0543  Slp family outer membrane lipoprotein  36.91 
 
 
165 aa  87.8  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01377  hypothetical protein  30.63 
 
 
185 aa  87.4  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2184  Slp family outer membrane lipoprotein  36.36 
 
 
204 aa  87  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1572  putative outer membrane lipoprotein Slp  37.16 
 
 
202 aa  86.7  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178723  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01135  Starvation-inducible outer membrane lipoprotein  29.89 
 
 
218 aa  86.3  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2347  outer membrane lipoprotein Slp  38.41 
 
 
155 aa  85.9  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.831306  normal  0.890388 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1817  Slp family outer membrane lipoprotein  31.03 
 
 
189 aa  85.5  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42187  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1992  outer membrane lipoprotein, Slp family  38.92 
 
 
209 aa  81.3  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2057  outer membrane lipoprotein Slp  34.33 
 
 
186 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000642718  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1429  Outer membrane lipoprotein Slp  35.38 
 
 
190 aa  79  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00755368  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0908  outer membrane lipoprotein, Slp family  36 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2172  outer membrane lipoprotein Slp  41.48 
 
 
177 aa  77.8  0.00000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3107  putative starvation-inducible outer membrane lipoprotein  31.39 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2011  outer membrane lipoprotein, Slp family  37.2 
 
 
205 aa  76.3  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.793199  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2066  outer membrane protein Slp  32.89 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1963  outer membrane protein Slp  33.57 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1894  outer membrane protein Slp  33.57 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1837  outer membrane lipoprotein, Slp family  33.57 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000126443  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1827  Slp family outer membrane lipoprotein  33.57 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.64405  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2032  outer membrane protein Slp  33.57 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2376  Slp family outer membrane lipoprotein  31.32 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01764  hypothetical protein  32.87 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.736998  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1382  outer membrane protein Slp  32.87 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.387794  normal  0.55237 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01776  predicted lipoprotein  32.87 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.994959  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2533  outer membrane protein Slp  32.21 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.31032  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1959  outer membrane protein Slp  32.87 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.286575  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2020  outer membrane protein Slp  32.87 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.251668  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1312  outer membrane protein Slp  32.87 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0266673  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1497  outer membrane protein Slp  32.87 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.443162  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2419  outer membrane lipoprotein Slp  41.74 
 
 
166 aa  70.5  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0101966 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2230  outer membrane lipoprotein, Slp family  33.08 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0678986  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1119  outer membrane lipoprotein Slp  40.79 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2761  Slp family outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 
196 aa  65.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000231326  hitchhiker  0.00115108 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1935  outer membrane lipoprotein, Slp family  32.31 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03307  hypothetical protein  28.92 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.656334  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0211  Slp family outer membrane lipoprotein  28.92 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0656913 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4854  outer membrane lipoprotein, Slp family  28.92 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3904  outer membrane lipoprotein, Slp family  28.92 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3799  Slp family outer membrane lipoprotein  28.92 
 
 
240 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.266438 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3992  Slp family outer membrane lipoprotein  28.92 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3708  Slp family outer membrane lipoprotein  28.92 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00034327  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03354  outer membrane lipoprotein  28.92 
 
 
188 aa  65.5  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0208  outer membrane lipoprotein, Slp family  28.92 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2126  Slp family outer membrane lipoprotein  31.03 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2404  Slp family outer membrane lipoprotein  31.03 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000394448  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2015  Slp family outer membrane lipoprotein  31.03 
 
 
195 aa  63.9  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000421651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>