19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1324 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1324  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  548  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4012  hypothetical protein  43.22 
 
 		 274 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1397  hypothetical protein  47.1 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157715  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0115  hypothetical protein  43.53 
 
 		 277 aa  202  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0529  hypothetical protein  29.67 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.11 
 
 		 3602 aa  68.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3731  hypothetical protein  36.97 
 
 		 456 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0520  hypothetical protein  28.81 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4698  putative lipoprotein  27.12 
 
 		 172 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000879271 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1972  hypothetical protein  36.13 
 
 		 653 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0816765  normal  0.630779 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0640  putative lipoprotein  27.12 
 
 		 172 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0516  hypothetical protein  27.12 
 
 		 172 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0670  hypothetical protein  26.27 
 
 		 172 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0602  putative lipoprotein  26.27 
 
 		 172 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0658  putative lipoprotein  26.27 
 
 		 172 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9941600000000005e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0513  hypothetical protein  26.27 
 
 		 173 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000669276  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0511  hypothetical protein  26.27 
 
 		 173 aa  47  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0779722  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0569  putative lipoprotein  26.27 
 
 		 173 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000903334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0729  putative lipoprotein  26.27 
 
 		 172 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>