9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0692 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0692  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  885    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6469  hypothetical protein  42.73 
 
 		 470 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.974318  normal  0.5952 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5717  hypothetical protein  42.15 
 
 		 470 aa  269  8.999999999999999e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6929  hypothetical protein  42.7 
 
 		 470 aa  268  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1442  hypothetical protein  42.63 
 
 		 470 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6386  hypothetical protein  42.63 
 
 		 470 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.822909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7050  hypothetical protein  42.92 
 
 		 470 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5379  hypothetical protein  39.82 
 
 		 473 aa  256  7e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.17303  normal  0.211266 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5826  hypothetical protein  39.33 
 
 		 450 aa  229  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>