31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0486 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0486  putative lipoprotein  100 
 
 		 249 aa  506  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2497  putative lipoprotein  53.05 
 
 		 233 aa  234  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2848  putative lipoprotein  50.47 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548247  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2769  lipoprotein, putative  55.43 
 
 		 233 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.100349  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4129  putative lipoprotein  33.63 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3781  hypothetical protein  33.63 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0025  putative lipoprotein  33.63 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0071  hypothetical protein  33.79 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4030  hypothetical protein  32.73 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.149131  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3861  hypothetical protein  32.73 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3842  hypothetical protein  32.73 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3970  hypothetical protein  32.73 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3926  hypothetical protein  32.73 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3875  putative lipoprotein  33.01 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4930  putative lipoprotein  33.01 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.723884 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03355  hypothetical protein  33.01 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03404  hypothetical protein  33.01 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0162  hypothetical protein  33.01 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4050  putative lipoprotein  33.01 
 
 		 236 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3755  putative lipoprotein  33.01 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0158  conserved hypothetical protein  33.01 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3972  putative lipoprotein  32.52 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0165  putative outer membrane lipoprotein  31.55 
 
 		 236 aa  111  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4448  hypothetical protein  32.14 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0051  hypothetical protein  34.62 
 
 		 236 aa  108  8.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.677527  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0070  hypothetical protein  32.08 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4166  hypothetical protein  31.7 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1256  hypothetical protein  25.56 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0115966  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2000  putative inner membrane lipoprotein  25 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000329857  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1300  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  hitchhiker  0.0000000131043 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1285  hypothetical protein  25 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0098746  hitchhiker  0.0000000000621008 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>