31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3875 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_0158  conserved hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  481  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03404  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  481  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3755  putative lipoprotein  100 
 
 
236 aa  481  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4050  putative lipoprotein  99.58 
 
 
236 aa  480  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4930  putative lipoprotein  100 
 
 
236 aa  481  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.723884 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0162  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  481  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3875  putative lipoprotein  100 
 
 
236 aa  481  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03355  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  481  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3972  putative lipoprotein  99.15 
 
 
236 aa  478  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3842  hypothetical protein  88.98 
 
 
236 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3861  hypothetical protein  88.98 
 
 
236 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3970  hypothetical protein  88.98 
 
 
236 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.476505  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4030  hypothetical protein  88.98 
 
 
236 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.149131  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3926  hypothetical protein  88.98 
 
 
236 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0165  putative outer membrane lipoprotein  84.75 
 
 
236 aa  421  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0071  hypothetical protein  51.46 
 
 
239 aa  256  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.249103  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0025  putative lipoprotein  53.05 
 
 
239 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3781  hypothetical protein  53.05 
 
 
239 aa  240  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4129  putative lipoprotein  53.05 
 
 
239 aa  240  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0051  hypothetical protein  47 
 
 
236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.677527  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4448  hypothetical protein  46.05 
 
 
238 aa  202  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0070  hypothetical protein  42.86 
 
 
236 aa  192  4e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4166  hypothetical protein  43.72 
 
 
238 aa  191  7e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0486  putative lipoprotein  33.01 
 
 
249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2848  putative lipoprotein  33.49 
 
 
233 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548247  normal  0.417935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2769  lipoprotein, putative  32.4 
 
 
233 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.100349  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2497  putative lipoprotein  30.62 
 
 
233 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.355011  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2000  putative inner membrane lipoprotein  28.35 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000329857  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1300  hypothetical protein  28.35 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  hitchhiker  0.0000000131043 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1256  hypothetical protein  28.35 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0115966  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1285  hypothetical protein  27.84 
 
 
253 aa  72  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0098746  hitchhiker  0.0000000000621008 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>