17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1035 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1035  probable tail tube protein  100 
 
 		 151 aa  306  5.9999999999999995e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2792  phage protein  58.28 
 
 		 151 aa  184  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3484  phage protein  58.28 
 
 		 151 aa  179  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.596949  hitchhiker  5.08403e-16 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2928  phage protein  58.28 
 
 		 151 aa  179  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.49647e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0696  tail tube  58.22 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5060  tail tube  58.22 
 
 		 149 aa  179  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.114131  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0905  putative phage gene  56.76 
 
 		 150 aa  167  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0160336  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1049  tail tube  55.78 
 
 		 152 aa  167  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1464  prophage PSPPH06, putative tail tube protein  50.34 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.366521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2759  prophage PSPPH06, putative tail tube protein  50.34 
 
 		 162 aa  148  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0703  prophage PSPPH06, putative tail tube protein  47.97 
 
 		 149 aa  143  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0729  prophage PSPPH06, putative tail tube protein  43.84 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00979079  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1291  prophage PSPPH06, putative tail tube protein  43.84 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05033  hypothetical protein  45.33 
 
 		 151 aa  137  7e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0247  prophage PSPPH06, putative tail tube protein  46.36 
 
 		 156 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0579  prophage PSPPH06, putative tail tube protein  40.41 
 
 		 147 aa  115  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00736271  normal  0.384047 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0935  hypothetical protein  46.51 
 
 		 96 aa  84.3  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.393564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>