17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1464 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1464  prophage PSPPH06, putative tail tube protein  100 
 
 		 162 aa  327  3e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.366521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2759  prophage PSPPH06, putative tail tube protein  100 
 
 		 162 aa  327  3e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0247  prophage PSPPH06, putative tail tube protein  66.03 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5060  tail tube  62.76 
 
 		 149 aa  177  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.114131  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0696  tail tube  62.76 
 
 		 149 aa  177  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1291  prophage PSPPH06, putative tail tube protein  50.34 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0729  prophage PSPPH06, putative tail tube protein  50.34 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00979079  normal  0.123404 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05033  hypothetical protein  49.32 
 
 		 151 aa  152  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2792  phage protein  49.66 
 
 		 151 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1035  probable tail tube protein  50.34 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0905  putative phage gene  50.68 
 
 		 150 aa  148  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0160336  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2928  phage protein  47.65 
 
 		 151 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.49647e-16 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3484  phage protein  47.65 
 
 		 151 aa  144  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.596949  hitchhiker  5.08403e-16 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0703  prophage PSPPH06, putative tail tube protein  48.99 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1049  tail tube  42.48 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0579  prophage PSPPH06, putative tail tube protein  42.07 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00736271  normal  0.384047 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0935  hypothetical protein  43.02 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.393564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>