67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02089 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02089  hypothetical protein  100 
 
 
44 aa  90.1  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1528  hypothetical protein  72.22 
 
 
126 aa  60.5  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2401  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.5 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0045  ring-cleaving dioxygenase  66.67 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.985794  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2351  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.5 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2806  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.85 
 
 
131 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1574  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.85 
 
 
131 aa  57  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166496  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.85 
 
 
131 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.823568  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1544  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.41 
 
 
131 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4634  ring-cleaving dioxygenase  65.79 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1734  glyoxalase family protein  63.41 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1474  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.44 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.781159  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1001  extradiol ring-cleaving dioxygenase, putative  56.1 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2621  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  72.22 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000365872  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2554  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  72.22 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4030  hypothetical protein  64.86 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.581742 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  67.57 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1277  hitchhiker  0.00852425 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0943  putative extradiol ring-cleaving dioxygenase  56.1 
 
 
128 aa  54.7  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52890  ring-cleaving dioxygenase  63.16 
 
 
126 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.908262  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1439  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.27 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1338  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.51 
 
 
131 aa  52.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.184325  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1322  hypothetical protein  57.5 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1415  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.5 
 
 
127 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4049  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.11 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2721  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.44 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0872  glyoxalase family protein  60 
 
 
132 aa  51.2  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0132  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.16 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2211  30S ribosomal protein S15  69.7 
 
 
130 aa  50.4  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4359  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  51.22 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  hitchhiker  0.00717168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2595  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  64.71 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.581989 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0866  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.14 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2800  glyoxalase family protein  70 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4553  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.05 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2424  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.780094  hitchhiker  0.00163116 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1591  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.5 
 
 
130 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0767303  normal  0.10787 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3172  glyoxalase family protein  70 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.139884  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.468879 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4115  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.56 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.726445  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3893  glyoxalase, putative  62.5 
 
 
129 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222146  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.29 
 
 
130 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.930007  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2987  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.29 
 
 
128 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.382223  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2716  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.38 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0848  hypothetical protein  57.58 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7861  hypothetical protein  50 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.433206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3266  putative metallothiol transferase  55.88 
 
 
126 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3120  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
147 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187371 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4854  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.88 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0294126 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3017  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.88 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1623  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.88 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0844226  normal  0.672862 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1601  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.88 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1665  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.88 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675925  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2894  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1693  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.88 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3507  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65.62 
 
 
130 aa  45.1  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2855  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.85 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1685  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.5 
 
 
127 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1453  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0851141  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1553  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  56.25 
 
 
127 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.111375 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2439  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  45 
 
 
130 aa  42  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003185  hypothetical protein  48.65 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003189  hypothetical protein  48.65 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003199  hypothetical protein  48.65 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4038  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.38 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62216  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_003296  RS03174  hypothetical protein  56.25 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1449  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  62.07 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5014  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458223  normal  0.186133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>