81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2595 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2595  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
125 aa  259  1e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.581989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3893  glyoxalase, putative  83.74 
 
 
129 aa  218  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222146  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1591  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  81.3 
 
 
130 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0767303  normal  0.10787 
 
 
-
 
NC_003296  RS03174  hypothetical protein  75.61 
 
 
126 aa  198  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1601  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  77.24 
 
 
127 aa  197  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1665  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  77.24 
 
 
127 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675925  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  77.24 
 
 
127 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1693  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  77.24 
 
 
127 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1623  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  76.42 
 
 
127 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0844226  normal  0.672862 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4854  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  74.8 
 
 
127 aa  192  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0294126 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3507  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  72.66 
 
 
130 aa  187  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3266  putative metallothiol transferase  72.36 
 
 
126 aa  185  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.483715  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4115  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.73 
 
 
127 aa  186  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.726445  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1553  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  71.54 
 
 
127 aa  184  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.111375 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2987  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.6 
 
 
128 aa  183  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.382223  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4038  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.31 
 
 
130 aa  182  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62216  normal  0.538689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4634  ring-cleaving dioxygenase  64.52 
 
 
126 aa  160  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52890  ring-cleaving dioxygenase  63.71 
 
 
126 aa  159  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.908262  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2721  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.48 
 
 
131 aa  159  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2621  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.48 
 
 
131 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000365872  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2554  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  60.48 
 
 
131 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000223181  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1415  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  59.35 
 
 
127 aa  158  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1322  hypothetical protein  59.35 
 
 
127 aa  158  2e-38  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4049  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.98 
 
 
141 aa  158  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0132  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  63.41 
 
 
125 aa  156  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1734  glyoxalase family protein  58.06 
 
 
131 aa  152  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4359  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.68 
 
 
128 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  hitchhiker  0.00717168 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1439  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.26 
 
 
131 aa  147  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2349  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.2 
 
 
125 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1277  hitchhiker  0.00852425 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1474  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.68 
 
 
134 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.781159  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1540  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.65 
 
 
131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.823568  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1544  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.65 
 
 
131 aa  143  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1574  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.65 
 
 
131 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.166496  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2806  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.65 
 
 
131 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.981358  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1001  extradiol ring-cleaving dioxygenase, putative  52.42 
 
 
128 aa  135  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0943  putative extradiol ring-cleaving dioxygenase  52.42 
 
 
128 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.784834  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0872  glyoxalase family protein  52.07 
 
 
132 aa  134  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1449  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.07 
 
 
173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444424  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3172  glyoxalase family protein  52.89 
 
 
132 aa  131  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.139884  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1528  hypothetical protein  52.42 
 
 
126 aa  131  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2768  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.89 
 
 
132 aa  131  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.468879 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2800  glyoxalase family protein  52.07 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2424  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  52.07 
 
 
132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.780094  hitchhiker  0.00163116 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0045  ring-cleaving dioxygenase  52.1 
 
 
126 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.985794  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2401  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.76 
 
 
128 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2351  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.76 
 
 
128 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1338  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.8 
 
 
131 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.184325  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1453  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.44 
 
 
126 aa  107  4.0000000000000004e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0851141  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.9 
 
 
130 aa  107  7.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.930007  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4553  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  45.24 
 
 
135 aa  100  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2211  30S ribosomal protein S15  42.4 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0866  putative glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.86 
 
 
135 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.271535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7861  hypothetical protein  43.08 
 
 
136 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.433206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4030  hypothetical protein  41.41 
 
 
135 aa  92  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.581742 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2855  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.54 
 
 
147 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0772639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2716  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.54 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3017  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.54 
 
 
147 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02088  hypothetical protein  57.75 
 
 
90 aa  87  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1815  putative ring-cleaving dioxygenase  45.83 
 
 
106 aa  86.3  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00491461  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2894  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.02 
 
 
147 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531023  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3120  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.02 
 
 
147 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187371 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2439  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase superfamily protein  39.5 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5014  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.18 
 
 
146 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458223  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003189  hypothetical protein  42.11 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003185  hypothetical protein  42.11 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003199  hypothetical protein  43.16 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0952  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.83 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0964  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.59 
 
 
149 aa  72  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0751466  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1729  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.82 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759057  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3833  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.14 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02089  hypothetical protein  64.71 
 
 
44 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1685  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.69 
 
 
127 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.162999 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0566  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.2 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0848  hypothetical protein  30.71 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0614  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.81 
 
 
274 aa  42.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000895  lactoylglutathione lyase  30.53 
 
 
141 aa  41.6  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0037  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.46 
 
 
129 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0410  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.8 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.909465 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1250  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.56 
 
 
152 aa  41.2  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1699  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
129 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268635  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0952  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.71 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>