50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00215 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00215  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  401  1e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002180  hypothetical protein  96.92 
 
 		 195 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.105227  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2646  hypothetical protein  80 
 
 		 222 aa  327  5.0000000000000004e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2848  hypothetical protein  71.79 
 
 		 197 aa  294  7e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.044435  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4490  hypothetical protein  59.59 
 
 		 196 aa  237  8e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.140109  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3995  protein of unknown function DUF416  59.07 
 
 		 196 aa  237  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03829  hypothetical protein  59.07 
 
 		 196 aa  237  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4447  hypothetical protein  59.07 
 
 		 196 aa  237  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.488433  hitchhiker  0.000696579 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4026  hypothetical protein  59.07 
 
 		 196 aa  237  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0175566 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4542  hypothetical protein  59.07 
 
 		 196 aa  237  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.69  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4233  hypothetical protein  59.07 
 
 		 196 aa  237  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03876  hypothetical protein  59.07 
 
 		 196 aa  237  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.955306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5468  hypothetical protein  59.07 
 
 		 196 aa  235  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.272447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4576  hypothetical protein  58.03 
 
 		 196 aa  235  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.549774 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4413  hypothetical protein  58.03 
 
 		 196 aa  235  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.380107  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4500  hypothetical protein  58.03 
 
 		 196 aa  235  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38713  normal  0.0975935 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4502  hypothetical protein  58.03 
 
 		 196 aa  235  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00598133 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0212  hypothetical protein  59.07 
 
 		 196 aa  234  8e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0171046  normal  0.0123051 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0289  hypothetical protein  58.46 
 
 		 196 aa  233  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0272333  normal  0.0117545 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4380  hypothetical protein  57.51 
 
 		 196 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3865  protein of unknown function DUF416  56.92 
 
 		 196 aa  228  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.946564  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3711  protein of unknown function DUF416  56.41 
 
 		 196 aa  226  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.610498  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0221  hypothetical protein  55.9 
 
 		 196 aa  225  3e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0225  protein of unknown function DUF416  55.9 
 
 		 196 aa  224  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.254362  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0353  hypothetical protein  55.38 
 
 		 196 aa  222  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.153938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0461  hypothetical protein  55.38 
 
 		 196 aa  222  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.534971  hitchhiker  0.00251619 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3847  hypothetical protein  55.38 
 
 		 196 aa  222  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.397405  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1539  hypothetical protein  50.51 
 
 		 199 aa  199  3e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000333486  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1030  hypothetical protein  35.6 
 
 		 201 aa  117  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1199  hypothetical protein  35.08 
 
 		 200 aa  115  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3942  hypothetical protein  38.3 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00422867  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1179  hypothetical protein  34.21 
 
 		 201 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.290271  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1108  hypothetical protein  36.65 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.366386 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1284  hypothetical protein  33.68 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000586113 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1108  hypothetical protein  35.08 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1174  hypothetical protein  35.08 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.987719  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3458  hypothetical protein  34.03 
 
 		 199 aa  104  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2768  hypothetical protein  34.03 
 
 		 199 aa  104  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.11474  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1190  hypothetical protein  32.46 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000169624  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3217  hypothetical protein  33.33 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3149  hypothetical protein  32.46 
 
 		 199 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136473  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3147  hypothetical protein  32.46 
 
 		 199 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1222  protein of unknown function DUF416  32.46 
 
 		 199 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.254012  hitchhiker  0.00253499 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3292  hypothetical protein  32.46 
 
 		 199 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0753393  hitchhiker  0.0006441 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3356  hypothetical protein  31.41 
 
 		 201 aa  98.2  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431823 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03539  putative orphan protein  43.33 
 
 		 192 aa  97.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1046  hypothetical protein  31.94 
 
 		 201 aa  95.9  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0515  hypothetical protein  32.65 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0153  hypothetical protein  44.44 
 
 		 211 aa  88.6  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0942  hypothetical protein  30.1 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>