28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001296 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001296  ethanolamine utilization protein eutQ  100 
 
 
116 aa  239  6e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5369  hypothetical protein  75 
 
 
123 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1304  ethanolamine utilisation EutQ family protein  35.42 
 
 
236 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2634  ethanolamine utilisation EutQ family protein  33.7 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1229  ethanolamine utilisation EutQ family protein  36 
 
 
232 aa  63.5  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3681  ethanolamine utilization protein EutQ  29.46 
 
 
233 aa  63.2  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2606  ethanolamine utilization protein EutQ  29.46 
 
 
233 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1210  Ethanolamine utilisation EutQ familiy protein  28.57 
 
 
233 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1058  Ethanolamine utilisation EutQ family protein  30.21 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1217  ethanolamine utilisation EutQ family protein  28.57 
 
 
233 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2589  ethanolamine utilization protein EutQ  28.57 
 
 
233 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0903  ethanolamine utilization protein EutQ  29.63 
 
 
157 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0205632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1426  ethanolamine utilisation EutQ family protein  30.77 
 
 
209 aa  61.2  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2613  ethanolamine utilization protein EutQ  28.57 
 
 
229 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2835  ethanolamine utilization protein EutQ  28.57 
 
 
229 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2702  ethanolamine utilization protein EutQ  28.57 
 
 
229 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2728  ethanolamine utilization protein EutQ  28.57 
 
 
229 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2661  ethanolamine utilization protein EutQ  28.57 
 
 
229 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02313  hypothetical protein  28.57 
 
 
233 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02351  hypothetical protein  28.57 
 
 
233 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2737  ethanolamine utilization protein EutQ  28.57 
 
 
233 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3268  ethanolamine utilisation EutQ family protein  28.7 
 
 
223 aa  60.1  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.622249  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2826  ethanolamine utilization protein EutQ  27.68 
 
 
233 aa  58.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233091  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0081  Ethanolamine utilisation EutQ family protein  31.91 
 
 
187 aa  58.5  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4029  ethanolamine utilisation EutQ family protein  30.67 
 
 
187 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.195443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0768  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 
116 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  25.93 
 
 
220 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1850  protein of unknown function DUF861, cupin_3  31.19 
 
 
117 aa  44.3  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.346114  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>