34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4029 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4029  ethanolamine utilisation EutQ family protein  100 
 
 
187 aa  370  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.195443  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1229  ethanolamine utilisation EutQ family protein  33.19 
 
 
232 aa  112  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02351  hypothetical protein  32.17 
 
 
233 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1058  Ethanolamine utilisation EutQ family protein  39.37 
 
 
153 aa  105  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02313  hypothetical protein  32.17 
 
 
233 aa  105  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1210  Ethanolamine utilisation EutQ familiy protein  52.81 
 
 
233 aa  105  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1217  ethanolamine utilisation EutQ family protein  52.81 
 
 
233 aa  105  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2589  ethanolamine utilization protein EutQ  52.81 
 
 
233 aa  104  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2606  ethanolamine utilization protein EutQ  52.81 
 
 
233 aa  104  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3681  ethanolamine utilization protein EutQ  52.81 
 
 
233 aa  104  8e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2737  ethanolamine utilization protein EutQ  51.69 
 
 
233 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2835  ethanolamine utilization protein EutQ  50.56 
 
 
229 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2613  ethanolamine utilization protein EutQ  50 
 
 
229 aa  101  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2702  ethanolamine utilization protein EutQ  50 
 
 
229 aa  101  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2728  ethanolamine utilization protein EutQ  50 
 
 
229 aa  101  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2661  ethanolamine utilization protein EutQ  50 
 
 
229 aa  101  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1304  ethanolamine utilisation EutQ family protein  30.34 
 
 
236 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2826  ethanolamine utilization protein EutQ  50 
 
 
233 aa  100  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233091  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0081  Ethanolamine utilisation EutQ family protein  48.94 
 
 
187 aa  97.4  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0903  ethanolamine utilization protein EutQ  46.51 
 
 
157 aa  97.4  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0205632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2634  ethanolamine utilisation EutQ family protein  43.02 
 
 
152 aa  95.5  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1426  ethanolamine utilisation EutQ family protein  26.57 
 
 
209 aa  85.9  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3268  ethanolamine utilisation EutQ family protein  25.66 
 
 
223 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.622249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  26.46 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0359  ethanolamine utilisation EutQ family protein  25.6 
 
 
205 aa  58.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1203  hypothetical protein  41.67 
 
 
124 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782617  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5133  hypothetical protein  41.67 
 
 
124 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1850  protein of unknown function DUF861, cupin_3  37.7 
 
 
117 aa  52.4  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.346114  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08752  ethanolamine utilization protein (EutQ), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02845)  39.44 
 
 
119 aa  51.2  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4814  Ethanolamine utilization protein-like protein  35.37 
 
 
127 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001296  ethanolamine utilization protein eutQ  30.67 
 
 
116 aa  48.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5369  hypothetical protein  32 
 
 
123 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3244  hypothetical protein  25.56 
 
 
145 aa  44.3  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0768  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.22 
 
 
116 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>