29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5369 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5369  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  251  3e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001296  ethanolamine utilization protein eutQ  75 
 
 		 116 aa  179  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1304  ethanolamine utilisation EutQ family protein  32.52 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3681  ethanolamine utilization protein EutQ  27.97 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2606  ethanolamine utilization protein EutQ  27.97 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2634  ethanolamine utilisation EutQ family protein  32.35 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1210  Ethanolamine utilisation EutQ familiy protein  27.12 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1217  ethanolamine utilisation EutQ family protein  27.12 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2589  ethanolamine utilization protein EutQ  27.12 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0903  ethanolamine utilization protein EutQ  31.58 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0205632  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02351  hypothetical protein  27.12 
 
 		 233 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02313  hypothetical protein  27.12 
 
 		 233 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2835  ethanolamine utilization protein EutQ  28.21 
 
 		 229 aa  64.3  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2661  ethanolamine utilization protein EutQ  28.21 
 
 		 229 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2728  ethanolamine utilization protein EutQ  28.21 
 
 		 229 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2702  ethanolamine utilization protein EutQ  28.21 
 
 		 229 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2613  ethanolamine utilization protein EutQ  28.21 
 
 		 229 aa  64.3  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2737  ethanolamine utilization protein EutQ  27.12 
 
 		 233 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2826  ethanolamine utilization protein EutQ  26.27 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.233091  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1058  Ethanolamine utilisation EutQ family protein  31.25 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1229  ethanolamine utilisation EutQ family protein  32.98 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0081  Ethanolamine utilisation EutQ family protein  32.99 
 
 		 187 aa  57  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3268  ethanolamine utilisation EutQ family protein  30.59 
 
 		 223 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.622249  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1426  ethanolamine utilisation EutQ family protein  28.71 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4894  protein of unknown function DUF861 cupin_3  28.3 
 
 		 220 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1850  protein of unknown function DUF861, cupin_3  33.64 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.346114  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4029  ethanolamine utilisation EutQ family protein  32 
 
 		 187 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.195443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0768  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.75 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3374  hypothetical protein  27.63 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.195522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>