11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1792 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1792  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0096  hypothetical protein  61.29 
 
 
98 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.515337  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0971  ATP-cone domain-containing protein  61.54 
 
 
91 aa  107  5e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.230832  normal  0.0179048 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0053  hypothetical protein  62.64 
 
 
91 aa  105  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2041  hypothetical protein  61.54 
 
 
91 aa  105  2e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00446631 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2264  hypothetical protein  64.84 
 
 
91 aa  103  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.130297  normal  0.0315754 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1511  hypothetical protein  55.81 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0291892 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1709  hypothetical protein  43.68 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1010  ATP-cone domain-containing protein  43.82 
 
 
187 aa  55.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.91095  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3071  transcriptional regulator NrdR  34.62 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3049  transcriptional regulator NrdR  34.62 
 
 
179 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000710191  normal  0.330337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>