16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1010 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1010  ATP-cone domain-containing protein  100 
 
 
187 aa  368  1e-101  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.91095  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0156  hypothetical protein  62.23 
 
 
194 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.560417  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0053  hypothetical protein  48.28 
 
 
91 aa  71.2  0.000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0971  ATP-cone domain-containing protein  45.98 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.230832  normal  0.0179048 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2264  hypothetical protein  43.82 
 
 
91 aa  63.5  0.000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.130297  normal  0.0315754 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2041  hypothetical protein  43.68 
 
 
91 aa  62.8  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00446631 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1709  hypothetical protein  44.3 
 
 
102 aa  56.6  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1792  hypothetical protein  43.82 
 
 
93 aa  55.8  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1511  hypothetical protein  39.24 
 
 
84 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0291892 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0096  hypothetical protein  35.63 
 
 
98 aa  48.5  0.00005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.515337  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2433  hypothetical protein  34.72 
 
 
95 aa  48.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1471  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  41.67 
 
 
791 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0823956  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1227  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  40 
 
 
791 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.25361  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0728  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  40 
 
 
791 aa  46.6  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2381  restriction endonuclease  37.31 
 
 
276 aa  43.5  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1241  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  35.59 
 
 
768 aa  43.5  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>