26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3548 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3548  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  203  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.484392  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3938  protein of unknown function DUF1416  82 
 
 		 101 aa  169  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5102  hypothetical protein  67 
 
 		 100 aa  145  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4530  hypothetical protein  68 
 
 		 100 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4617  hypothetical protein  68 
 
 		 100 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4913  hypothetical protein  68 
 
 		 100 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1645  hypothetical protein  68 
 
 		 100 aa  144  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00974683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10829  hypothetical protein  65 
 
 		 100 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13138  hypothetical protein  65 
 
 		 100 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.31784 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0341  hypothetical protein  60.61 
 
 		 111 aa  120  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247134  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0297  hypothetical protein  59.6 
 
 		 108 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1031  hypothetical protein  56.57 
 
 		 112 aa  103  9e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4987  hypothetical protein  57 
 
 		 99 aa  103  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4641  hypothetical protein  61.36 
 
 		 97 aa  101  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.851327  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6829  hypothetical protein  52.53 
 
 		 100 aa  99.8  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37720  Protein of unknown function (DUF1416)  50 
 
 		 101 aa  90.5  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0603  hypothetical protein  48.48 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4229  hypothetical protein  59.21 
 
 		 98 aa  83.6  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8245  hypothetical protein  59.52 
 
 		 99 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6168  hypothetical protein  45.54 
 
 		 99 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0450  hypothetical protein  45.54 
 
 		 99 aa  80.1  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.550734 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0461  hypothetical protein  49.41 
 
 		 99 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.499605  normal  0.417084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0903  hypothetical protein  50.67 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0060  hypothetical protein  44.55 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2718  hypothetical protein  45.45 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834871  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4350  protein of unknown function DUF1416  40.43 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285626  normal  0.526557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>