26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37720 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_37720  Protein of unknown function (DUF1416)  100 
 
 		 101 aa  201  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6829  hypothetical protein  58 
 
 		 100 aa  113  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3938  protein of unknown function DUF1416  55.1 
 
 		 101 aa  105  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4987  hypothetical protein  64.63 
 
 		 99 aa  103  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1645  hypothetical protein  52.04 
 
 		 100 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00974683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10829  hypothetical protein  52.04 
 
 		 100 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13138  hypothetical protein  52.04 
 
 		 100 aa  93.6  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.31784 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4530  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4617  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4913  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5102  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  91.7  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3548  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  90.5  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.484392  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0341  hypothetical protein  49 
 
 		 111 aa  88.2  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247134  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4641  hypothetical protein  50.59 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.851327  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0297  hypothetical protein  48 
 
 		 108 aa  84  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8245  hypothetical protein  49 
 
 		 99 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1031  hypothetical protein  48.51 
 
 		 112 aa  82  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4350  protein of unknown function DUF1416  45.56 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285626  normal  0.526557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0461  hypothetical protein  54.55 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.499605  normal  0.417084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0903  hypothetical protein  54.55 
 
 		 98 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0603  hypothetical protein  46.08 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0060  hypothetical protein  48.24 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2718  hypothetical protein  44.19 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834871  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6168  hypothetical protein  44.05 
 
 		 99 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4229  hypothetical protein  47.46 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0450  hypothetical protein  45.07 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.550734 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>