26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0060 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0060  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  191  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8245  hypothetical protein  65.82 
 
 
99 aa  103  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757444  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0450  hypothetical protein  54.55 
 
 
99 aa  99.8  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.550734 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6168  hypothetical protein  50.51 
 
 
99 aa  94  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4229  hypothetical protein  51.02 
 
 
98 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0603  hypothetical protein  52.75 
 
 
102 aa  81.6  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4350  protein of unknown function DUF1416  51.76 
 
 
101 aa  80.5  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285626  normal  0.526557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0461  hypothetical protein  49.48 
 
 
99 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.499605  normal  0.417084 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4987  hypothetical protein  59.38 
 
 
99 aa  75.9  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4641  hypothetical protein  51.69 
 
 
97 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.851327  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2718  hypothetical protein  49.41 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834871  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0341  hypothetical protein  53.09 
 
 
111 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247134  hitchhiker  0.00208243 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0903  hypothetical protein  50 
 
 
98 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424265  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1645  hypothetical protein  46 
 
 
100 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00974683  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5102  hypothetical protein  46 
 
 
100 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13138  hypothetical protein  46.07 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.31784 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10829  hypothetical protein  46.07 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0111845 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3548  hypothetical protein  44.55 
 
 
101 aa  72  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.484392  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37720  Protein of unknown function (DUF1416)  48.24 
 
 
101 aa  70.1  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3938  protein of unknown function DUF1416  46.59 
 
 
101 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4617  hypothetical protein  46.07 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4530  hypothetical protein  46.07 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1031  hypothetical protein  46.91 
 
 
112 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4913  hypothetical protein  46.07 
 
 
100 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0297  hypothetical protein  48.15 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6829  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>