17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1677 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1677  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  253  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2113  membrane protein  59.3 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1206  hypothetical protein  51.9 
 
 
127 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5056  hypothetical protein  43.27 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5349  hypothetical protein  43.27 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4968  hypothetical protein  43.27 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2421  hypothetical protein  35.71 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0389814  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5602  hypothetical protein  49.38 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.871295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7191  hypothetical protein  43.12 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13792  hypothetical protein  50.62 
 
 
117 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618444 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0276  uncharacterized integral membrane protein-like protein  37.96 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0157  hypothetical protein  35.53 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517546  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1792  hypothetical protein  52.94 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07920  uncharacterized integral membrane protein  38.96 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.412015  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1739  hypothetical protein  38.16 
 
 
216 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00742515  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5112  membrane protein  41.03 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3031  hypothetical protein  44.9 
 
 
100 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>