16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1792 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1792  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  137  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1677  hypothetical protein  53.97 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2421  hypothetical protein  46.77 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0389814  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4968  hypothetical protein  53.57 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5056  hypothetical protein  53.57 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5349  hypothetical protein  53.57 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13792  hypothetical protein  53.57 
 
 		 117 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.618444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1206  hypothetical protein  55.77 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5602  hypothetical protein  53.85 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871295 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1739  hypothetical protein  54.9 
 
 		 216 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00742515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7191  hypothetical protein  53.7 
 
 		 182 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2113  membrane protein  52.94 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0157  hypothetical protein  40.98 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517546  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0276  uncharacterized integral membrane protein-like protein  50.94 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.21218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5112  membrane protein  48.33 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07920  uncharacterized integral membrane protein  45.61 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.412015  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>