16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07920 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_07920  uncharacterized integral membrane protein  100 
 
 
152 aa  303  5.0000000000000004e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.412015  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2421  hypothetical protein  30.87 
 
 
172 aa  60.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0389814  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1677  hypothetical protein  38.96 
 
 
126 aa  60.5  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0157  hypothetical protein  30.28 
 
 
121 aa  60.5  0.000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517546  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7191  hypothetical protein  38.2 
 
 
182 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13792  hypothetical protein  40.18 
 
 
117 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.618444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5602  hypothetical protein  47.83 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.871295 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1206  hypothetical protein  41.46 
 
 
127 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4968  hypothetical protein  35.29 
 
 
128 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5056  hypothetical protein  35.29 
 
 
128 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.677  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5349  hypothetical protein  35.29 
 
 
128 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2113  membrane protein  44.64 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1792  hypothetical protein  47.06 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.325178  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5112  membrane protein  46.67 
 
 
155 aa  43.9  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1423  hypothetical protein  31.91 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000706417  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1739  hypothetical protein  36 
 
 
216 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00742515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>