15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0317 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0317  paREP6  100 
 
 
67 aa  134  4e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0874035  normal  0.450582 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1358  paREP6  96.23 
 
 
67 aa  107  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.283608  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0319  paREP6  63.64 
 
 
71 aa  91.7  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.198848  normal  0.234499 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1356  paREP6  62.12 
 
 
71 aa  90.1  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.813145  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0942  paREP6  75 
 
 
73 aa  85.1  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.249069  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0660  PaREP6 domain-containing protein/PaREP6 domain-containing protein  74.51 
 
 
71 aa  83.2  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1007  PaREP6 domain-containing protein/PaREP6 domain-containing protein  65.08 
 
 
73 aa  81.3  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1270  paREP6  56.06 
 
 
74 aa  79  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.625572 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1009  PaREP6 domain-containing protein/PaREP6 domain-containing protein  64.15 
 
 
75 aa  75.5  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.817258 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2850  paREP6  51.52 
 
 
76 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.152275  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0940  paREP6  65.38 
 
 
71 aa  73.9  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.155485  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2852  conserved hypothetical protein  49.25 
 
 
78 aa  72.4  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470946  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1307  paREP6  55.77 
 
 
80 aa  71.6  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000645895  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1090  hypothetical protein  53.7 
 
 
77 aa  69.7  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.985366 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0091  PaREP6 domain-containing protein/PaREP6 domain-containing protein  67.35 
 
 
62 aa  68.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000241761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>