15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0091 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_0091  PaREP6 domain-containing protein/PaREP6 domain-containing protein  100 
 
 
62 aa  124  6e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000241761 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0317  paREP6  67.35 
 
 
67 aa  68.2  0.00000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0874035  normal  0.450582 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1356  paREP6  57.14 
 
 
71 aa  60.5  0.000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.813145  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1358  paREP6  75 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.283608  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0319  paREP6  55.1 
 
 
71 aa  58.9  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.198848  normal  0.234499 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2852  conserved hypothetical protein  51.85 
 
 
78 aa  54.7  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470946  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1270  paREP6  51.85 
 
 
74 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.625572 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2850  paREP6  45.16 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.152275  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0940  paREP6  68.57 
 
 
71 aa  51.6  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.155485  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1090  hypothetical protein  50 
 
 
77 aa  50.8  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.985366 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0660  PaREP6 domain-containing protein/PaREP6 domain-containing protein  64.71 
 
 
71 aa  50.4  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1009  PaREP6 domain-containing protein/PaREP6 domain-containing protein  61.11 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.817258 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0942  paREP6  65.71 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.249069  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1007  PaREP6 domain-containing protein/PaREP6 domain-containing protein  48.21 
 
 
73 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1307  paREP6  58.54 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000645895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>