15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1270 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1270  paREP6  100 
 
 
74 aa  149  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.625572 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1356  paREP6  63.38 
 
 
71 aa  102  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.813145  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2850  paREP6  65.71 
 
 
76 aa  101  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.152275  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0319  paREP6  70.97 
 
 
71 aa  101  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.198848  normal  0.234499 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1009  PaREP6 domain-containing protein/PaREP6 domain-containing protein  74.07 
 
 
75 aa  91.7  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.817258 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0940  paREP6  67.31 
 
 
71 aa  85.5  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.155485  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2852  conserved hypothetical protein  56.34 
 
 
78 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470946  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0317  paREP6  56.06 
 
 
67 aa  79  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0874035  normal  0.450582 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1090  hypothetical protein  58.62 
 
 
77 aa  77.4  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.985366 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1307  paREP6  55.77 
 
 
80 aa  67.4  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000645895  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1358  paREP6  56.6 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.283608  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1007  PaREP6 domain-containing protein/PaREP6 domain-containing protein  47.14 
 
 
73 aa  65.1  0.0000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0660  PaREP6 domain-containing protein/PaREP6 domain-containing protein  55.1 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0942  paREP6  50 
 
 
73 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.249069  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0091  PaREP6 domain-containing protein/PaREP6 domain-containing protein  51.85 
 
 
62 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000241761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>