21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1472 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1472  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  687    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0171  hypothetical protein  47.6 
 
 
330 aa  288  7e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000347581 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3442  hypothetical protein  46.06 
 
 
348 aa  284  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.292639 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1512  hypothetical protein  48.34 
 
 
329 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0513739  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3158  hypothetical protein  46.32 
 
 
353 aa  270  2e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.830009  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6956  hypothetical protein  42.99 
 
 
338 aa  266  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0945  hypothetical protein  43.05 
 
 
333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0923  hypothetical protein  45.55 
 
 
324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.521999 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1366  hypothetical protein  41.28 
 
 
333 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2074  hypothetical protein  42.63 
 
 
341 aa  237  3e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000246905  hitchhiker  0.000133553 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1018  hypothetical protein  40.31 
 
 
355 aa  229  7e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244284  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0960  hypothetical protein  40 
 
 
355 aa  226  3e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2415  hypothetical protein  41.35 
 
 
334 aa  225  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132132  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2614  putative transmembrane protein  38.92 
 
 
351 aa  225  7e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4461  hypothetical protein  42.86 
 
 
272 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1978  hypothetical protein  33.9 
 
 
444 aa  185  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.258705 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1997  hypothetical protein  34.43 
 
 
340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.362486 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2246  hypothetical protein  34.03 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705372  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2278  hypothetical protein  38.69 
 
 
334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2907  hypothetical protein  30.09 
 
 
351 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2279  hypothetical protein  33.33 
 
 
131 aa  59.3  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>