20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2278 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_2278  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  687    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208565 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1978  hypothetical protein  84.77 
 
 
444 aa  486  1e-136  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.258705 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2246  hypothetical protein  57.23 
 
 
398 aa  196  5.000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705372  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3158  hypothetical protein  36.67 
 
 
353 aa  162  6e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.830009  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3442  hypothetical protein  37.8 
 
 
348 aa  160  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.292639 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1366  hypothetical protein  39.13 
 
 
333 aa  155  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0171  hypothetical protein  36.93 
 
 
330 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000347581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2415  hypothetical protein  37.55 
 
 
334 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132132  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0923  hypothetical protein  52.17 
 
 
324 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.521999 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1018  hypothetical protein  48.92 
 
 
355 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244284  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0960  hypothetical protein  37.97 
 
 
355 aa  139  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6956  hypothetical protein  36.44 
 
 
338 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0945  hypothetical protein  48.67 
 
 
333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2614  putative transmembrane protein  33.73 
 
 
351 aa  132  9e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1472  hypothetical protein  43.54 
 
 
337 aa  125  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1512  hypothetical protein  39.1 
 
 
329 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0513739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2074  hypothetical protein  37.11 
 
 
341 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000246905  hitchhiker  0.000133553 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1997  hypothetical protein  27.98 
 
 
340 aa  88.6  1e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.362486 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4461  hypothetical protein  35.37 
 
 
272 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2907  hypothetical protein  35.34 
 
 
351 aa  72.4  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>