21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0923 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0923  hypothetical protein  100 
 
 
324 aa  651    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.521999 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3442  hypothetical protein  58.26 
 
 
348 aa  335  3.9999999999999995e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.292639 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3158  hypothetical protein  51.59 
 
 
353 aa  306  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.830009  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0171  hypothetical protein  50.79 
 
 
330 aa  296  4e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000347581 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2415  hypothetical protein  45.16 
 
 
334 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132132  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1366  hypothetical protein  44.83 
 
 
333 aa  249  5e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.408698  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0945  hypothetical protein  49.24 
 
 
333 aa  248  7e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1472  hypothetical protein  45.55 
 
 
337 aa  246  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1018  hypothetical protein  44.63 
 
 
355 aa  239  5e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244284  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0960  hypothetical protein  44.3 
 
 
355 aa  237  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1978  hypothetical protein  38.69 
 
 
444 aa  229  7e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.258705 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6956  hypothetical protein  39.5 
 
 
338 aa  225  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2614  putative transmembrane protein  41.56 
 
 
351 aa  217  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.126642 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2246  hypothetical protein  41.75 
 
 
398 aa  203  4e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00705372  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1512  hypothetical protein  38.81 
 
 
329 aa  178  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0513739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2074  hypothetical protein  34.81 
 
 
341 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000246905  hitchhiker  0.000133553 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1997  hypothetical protein  32.42 
 
 
340 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.362486 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4461  hypothetical protein  36.05 
 
 
272 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2278  hypothetical protein  50.33 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00208565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2907  hypothetical protein  32.7 
 
 
351 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2279  hypothetical protein  40.37 
 
 
131 aa  71.6  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00183933 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>