163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2324 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2324  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  100 
 
 
304 aa  593  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0474  sugar isomerase (SIS)  70.41 
 
 
337 aa  389  1e-107  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.850822  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4021  glucokinase regulatory-like protein  63.45 
 
 
298 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0102369  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35990  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  62.2 
 
 
308 aa  317  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.065784  normal  0.17675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0268  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  61.41 
 
 
308 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.26686  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4517  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  64.77 
 
 
307 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.559309 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1219  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  49.65 
 
 
308 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3056  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  48.96 
 
 
308 aa  261  8e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004409  N-acetylmuramic acid 6-phosphate etherase  47.72 
 
 
309 aa  261  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1143  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  48.61 
 
 
295 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3619  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  48.61 
 
 
295 aa  257  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1249  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  48.61 
 
 
295 aa  257  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00989  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  46.71 
 
 
308 aa  256  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1199  glucokinase regulatory-like protein  45.61 
 
 
297 aa  252  6e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00595  glucokinase regulatory-like protein  47.24 
 
 
331 aa  252  7e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1079  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  48.96 
 
 
313 aa  250  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2775  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  46.71 
 
 
297 aa  248  7e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1512  glucokinase regulatory-like protein  45.36 
 
 
307 aa  247  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3125  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  46.44 
 
 
307 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0172  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  45.83 
 
 
302 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2881  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  43.92 
 
 
308 aa  242  5e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001001  N-acetylmuramic acid 6-phosphate etherase  44.44 
 
 
300 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0221  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  43.45 
 
 
307 aa  239  5e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3047  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  46.55 
 
 
297 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0580573 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25320  predicted sugar phosphate isomerase  50.71 
 
 
327 aa  236  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00271606  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2753  glucokinase regulatory-like protein  47.57 
 
 
310 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3803  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  44.9 
 
 
316 aa  235  9e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0010924  decreased coverage  0.000127342 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4168  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  44.93 
 
 
307 aa  234  9e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.396685  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1233  glucokinase regulatory-like protein  44.79 
 
 
298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2564  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  44.79 
 
 
298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1251  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  44.79 
 
 
298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.674779  normal  0.258404 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2583  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  43.43 
 
 
298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1260  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  42.71 
 
 
300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02328  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  43.39 
 
 
298 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2949  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  46.02 
 
 
297 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3658  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  43.39 
 
 
298 aa  233  3e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2714  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  43.39 
 
 
298 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3661  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  46.53 
 
 
297 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0485  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  44.96 
 
 
298 aa  233  3e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02289  hypothetical protein  43.39 
 
 
298 aa  233  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2800  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  43.39 
 
 
298 aa  233  3e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.505825  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2774  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  45.67 
 
 
297 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2814  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  45.67 
 
 
297 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.728479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2837  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  45.67 
 
 
297 aa  233  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.718204 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2617  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  45.49 
 
 
304 aa  230  2e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.423001  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3833  glucokinase regulatory-like protein  44.29 
 
 
294 aa  230  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2733  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  45.33 
 
 
297 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2585  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  42.42 
 
 
300 aa  228  9e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2465  glucokinase regulatory-like protein  45.83 
 
 
299 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1065  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  41.32 
 
 
299 aa  227  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0335  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  40.62 
 
 
303 aa  225  6e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.130147  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1121  glucokinase regulatory-like protein  43.29 
 
 
297 aa  223  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1469  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  41.78 
 
 
295 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00569055  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0620  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  48.62 
 
 
301 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0038  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  41.08 
 
 
297 aa  219  6e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1541  glucokinase regulatory-like protein  41.03 
 
 
291 aa  217  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2813  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  42.96 
 
 
295 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1241  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  41.52 
 
 
297 aa  216  5e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0357447  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0973  glucokinase regulatory-like protein  41.2 
 
 
296 aa  215  7e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0732  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  41.18 
 
 
294 aa  215  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1857  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  41.41 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000411565  hitchhiker  0.0000000817589 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1899  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  38.75 
 
 
295 aa  214  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0913  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  41.18 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.163609  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4459  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  40.83 
 
 
294 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.772989 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0340  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  38.36 
 
 
307 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0987  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  40.83 
 
 
294 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0242  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  42.01 
 
 
307 aa  211  9e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0918  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  41.18 
 
 
294 aa  211  9e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20197e-42 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0783  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  40.83 
 
 
294 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0876  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  40.48 
 
 
294 aa  211  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0822  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  40.83 
 
 
294 aa  211  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.199638  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4977  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  41.67 
 
 
306 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.889603 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0732  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  40.83 
 
 
294 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114997  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0718  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  40.83 
 
 
294 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08691  sugar phosphate isomerase  39.52 
 
 
303 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0143494 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7244  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  45.55 
 
 
301 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.304432  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4573  glucokinase regulatory-like protein  43.4 
 
 
306 aa  207  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.48035  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2034  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  40.14 
 
 
306 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0670  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  39.86 
 
 
294 aa  206  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2060  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  39.79 
 
 
306 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6538  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  43.41 
 
 
270 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.130206  normal  0.393534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0315  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  38.14 
 
 
310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11038  glucokinase regulator family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17490)  42.11 
 
 
373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.515331 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4817  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  40 
 
 
275 aa  198  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0176  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  38.97 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0181  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  38.97 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15151  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  40.97 
 
 
316 aa  196  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0916  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  42.21 
 
 
313 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799346  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3685  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  42.15 
 
 
267 aa  193  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1529  glucokinase regulatory-like protein  38.89 
 
 
295 aa  192  8e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00174969  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2577  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  39.93 
 
 
307 aa  190  2e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0238582  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5694  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  44.52 
 
 
305 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3065  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  42.46 
 
 
270 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09758  glucokinase regulator-related protein  42.21 
 
 
274 aa  191  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199964  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09881  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  37.8 
 
 
310 aa  188  8e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.165644 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2591  sugar isomerase (SIS)  45.1 
 
 
290 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5916  glucokinase regulatory-like protein  45.08 
 
 
270 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1663  glucokinase regulatory-like protein  46.45 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.203154 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3780  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  41.37 
 
 
268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4696  N-acetylmuramic acid-6-phosphate etherase  42.86 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>