284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2106 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2106  hypothetical protein  100 
 
 		 259 aa  512  1e-144  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  60.17 
 
 		 518 aa  264  1e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  55.64 
 
 		 518 aa  262  4.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  59.74 
 
 		 522 aa  261  6e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  54.33 
 
 		 514 aa  261  8.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  55.25 
 
 		 519 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  55.25 
 
 		 519 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  55.25 
 
 		 519 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  55.25 
 
 		 519 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  55.25 
 
 		 519 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  55.25 
 
 		 518 aa  257  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  55.25 
 
 		 518 aa  257  1e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  55.25 
 
 		 518 aa  257  1e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  55.25 
 
 		 518 aa  257  1e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  55.25 
 
 		 518 aa  257  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  55.25 
 
 		 518 aa  257  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  55.25 
 
 		 518 aa  257  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  55.25 
 
 		 518 aa  257  1e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  55.25 
 
 		 516 aa  256  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  56.1 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2953  Integral membrane protein TerC  57.77 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000321183  unclonable  0.0000000329078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  56.72 
 
 		 518 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  56.28 
 
 		 518 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  52.12 
 
 		 527 aa  252  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  55.51 
 
 		 253 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  55.98 
 
 		 295 aa  251  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  53.36 
 
 		 250 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  59.84 
 
 		 255 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  56.03 
 
 		 241 aa  249  4e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3839  hypothetical protein  53.28 
 
 		 254 aa  249  4e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  53.82 
 
 		 253 aa  249  4e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  57.26 
 
 		 523 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  56.3 
 
 		 523 aa  246  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  56.3 
 
 		 523 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1852  integral membrane protein TerC  58.44 
 
 		 522 aa  245  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  54.29 
 
 		 247 aa  245  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  54.74 
 
 		 239 aa  245  6e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  52.94 
 
 		 250 aa  244  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  55.88 
 
 		 523 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01969  fused predicted membrane protein/predicted membrane protein  53.28 
 
 		 527 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0999  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  53.28 
 
 		 527 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1594  Integral membrane protein TerC  53.28 
 
 		 527 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12256  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01958  hypothetical protein  53.28 
 
 		 527 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  53.85 
 
 		 522 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2356  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  53.28 
 
 		 527 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1578  integral membrane protein TerC  53.28 
 
 		 527 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1169  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  53.28 
 
 		 527 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2998  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  53.28 
 
 		 527 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.159646 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  52.52 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  52.52 
 
 		 250 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  53.44 
 
 		 522 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1984  Integral membrane protein TerC  55.47 
 
 		 517 aa  242  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  52.52 
 
 		 250 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1650  CBS domain-containing protein  52.94 
 
 		 522 aa  242  5e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2463  integral membrane protein TerC  52.94 
 
 		 514 aa  241  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2367  CBS domain-containing protein  52.94 
 
 		 514 aa  241  6e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3663  integral membrane protein TerC  50.81 
 
 		 510 aa  240  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1293  Integral membrane protein TerC  51.82 
 
 		 528 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0193  TerC family transport protein  52.61 
 
 		 518 aa  239  4e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.026546 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  51.43 
 
 		 248 aa  239  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1927  Integral membrane protein TerC  55.47 
 
 		 518 aa  239  4e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1762  integral membrane protein TerC  52.61 
 
 		 530 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171934  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  52.4 
 
 		 249 aa  238  5e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  55.08 
 
 		 249 aa  238  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1505  integral membrane protein TerC  54.07 
 
 		 244 aa  238  5.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  51.78 
 
 		 250 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0314  inner membrane protein  52.5 
 
 		 251 aa  238  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00210653  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  54.4 
 
 		 259 aa  238  8e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2868  Integral membrane protein TerC  54.03 
 
 		 529 aa  237  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1200  Integral membrane protein TerC  51.82 
 
 		 529 aa  236  2e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  50.2 
 
 		 259 aa  236  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  54.22 
 
 		 257 aa  236  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3038  Integral membrane protein TerC  51.82 
 
 		 577 aa  236  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2020  Integral membrane protein TerC  55.06 
 
 		 517 aa  236  4e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47040  TerC family protein  53.85 
 
 		 515 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53321  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  54.51 
 
 		 245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  52.12 
 
 		 246 aa  233  3e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9165  integral membrane protein TerC  56.3 
 
 		 254 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2450  CBS domain-containing protein  55.65 
 
 		 528 aa  232  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.889017  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  52.36 
 
 		 253 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  51.79 
 
 		 251 aa  231  7.000000000000001e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  52.36 
 
 		 253 aa  231  7.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  51.69 
 
 		 249 aa  231  8.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2058  integral membrane protein TerC  53.81 
 
 		 271 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0939102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11570  Integral membrane protein, TerC family  56.03 
 
 		 518 aa  231  9e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  50.2 
 
 		 250 aa  231  9e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4056  hypothetical protein  53.04 
 
 		 515 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1580  integral membrane protein TerC  54.84 
 
 		 528 aa  230  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.424407  normal  0.735145 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0779  integral membrane protein TerC  53.65 
 
 		 251 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2549  integral membrane protein TerC  55.22 
 
 		 528 aa  230  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.584861  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1260  integral membrane protein TerC  53.65 
 
 		 251 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0447301  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3192  CBS domain-containing protein  55.22 
 
 		 528 aa  230  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.237895  hitchhiker  0.00326333 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  52.81 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  51.97 
 
 		 253 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2798  integral membrane protein TerC  52.03 
 
 		 251 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.638851 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  49.79 
 
 		 253 aa  229  4e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2582  Integral membrane protein TerC  53.51 
 
 		 243 aa  228  6e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.218501 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2424  integral membrane protein TerC  54.27 
 
 		 252 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.350299  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  48.64 
 
 		 252 aa  228  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3705  integral membrane protein TerC  52.77 
 
 		 249 aa  227  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>