35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0307 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0307  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5888  conserved hypothetical membrane spanning protein  59.42 
 
 		 64 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0409145  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4755  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.507768  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5087  hypothetical protein  55 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0798995  normal  0.0598909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5141  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4841  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2504  hypothetical protein  63.41 
 
 		 72 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0865553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1431  hypothetical protein  46.58 
 
 		 71 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.30895  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4979  hypothetical protein  55.36 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0359  hypothetical protein  53.57 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177051  normal  0.83641 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2487  hypothetical protein  79.31 
 
 		 80 aa  55.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.713892  normal  0.311023 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0018  hypothetical protein  45.59 
 
 		 69 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5356  hypothetical protein  52 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4649  hypothetical protein  58.7 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5178  hypothetical protein  58.7 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.224865 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3437  hypothetical protein  50.82 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5289  hypothetical protein  55.36 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3078  hypothetical protein  55.36 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0646  hypothetical protein  52 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.145386  normal  0.355308 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2883  hypothetical protein  56 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.973654  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2250  hypothetical protein  60.98 
 
 		 70 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3465  hypothetical protein  47.69 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3462  hypothetical protein  58.54 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5842  hypothetical protein  44.26 
 
 		 74 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.470602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1803  hypothetical protein  50 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505321  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0163  hypothetical protein  54.35 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2601  hypothetical protein  61.76 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00128721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6612  hypothetical protein  51.67 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.227197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3174  hypothetical protein  51.22 
 
 		 69 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0507972  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4866  hypothetical protein  52.17 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377038  normal  0.371398 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0632  hypothetical protein  52.27 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3022  hypothetical protein  51.92 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1542  hypothetical protein  58.82 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118924  normal  0.120472 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0879  hypothetical protein  45.24 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.35012 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3241  hypothetical protein  56.25 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.507104  normal  0.343568 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>