14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0879 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0879  hypothetical protein  100 
 
 
71 aa  148  2e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.35012 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0632  hypothetical protein  43.55 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3022  hypothetical protein  35.21 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4649  hypothetical protein  46.15 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4979  hypothetical protein  46 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5178  hypothetical protein  46.15 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5356  hypothetical protein  47.62 
 
 
71 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3437  hypothetical protein  29.63 
 
 
74 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0359  hypothetical protein  44 
 
 
69 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177051  normal  0.83641 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1803  hypothetical protein  35.21 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505321  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1431  hypothetical protein  47.62 
 
 
71 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.30895  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5842  hypothetical protein  46.34 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.470602  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4755  hypothetical protein  47.62 
 
 
72 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.507768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4841  hypothetical protein  47.62 
 
 
72 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>