33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5289 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5289  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3078  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4979  hypothetical protein  98.55 
 
 
69 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0359  hypothetical protein  97.1 
 
 
69 aa  134  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.177051  normal  0.83641 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4649  hypothetical protein  95.65 
 
 
69 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.944237 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5178  hypothetical protein  95.65 
 
 
69 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.224865 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5087  hypothetical protein  79.71 
 
 
69 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0798995  normal  0.0598909 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3462  hypothetical protein  73.91 
 
 
73 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3437  hypothetical protein  80.95 
 
 
74 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3465  hypothetical protein  68.12 
 
 
69 aa  103  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.545839 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6612  hypothetical protein  79.45 
 
 
73 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.227197  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2250  hypothetical protein  72.58 
 
 
70 aa  100  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2601  hypothetical protein  79.41 
 
 
77 aa  100  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00128721  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2504  hypothetical protein  69.12 
 
 
72 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0865553 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3022  hypothetical protein  68.12 
 
 
74 aa  100  9e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3174  hypothetical protein  66.67 
 
 
69 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0507972  normal  0.348394 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0163  hypothetical protein  58.67 
 
 
73 aa  86.7  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4866  hypothetical protein  69.23 
 
 
80 aa  84  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.377038  normal  0.371398 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2883  hypothetical protein  54.17 
 
 
72 aa  82.4  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.973654  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1542  hypothetical protein  68.12 
 
 
69 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.118924  normal  0.120472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3241  hypothetical protein  61.64 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.507104  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4841  hypothetical protein  43.06 
 
 
72 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4755  hypothetical protein  43.06 
 
 
72 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.507768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5356  hypothetical protein  54.17 
 
 
71 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5141  hypothetical protein  41.67 
 
 
72 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1431  hypothetical protein  54.17 
 
 
71 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.30895  normal  0.771045 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5842  hypothetical protein  47.3 
 
 
74 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.470602  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0646  hypothetical protein  40.28 
 
 
75 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.145386  normal  0.355308 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0018  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  53.9  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.962598  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1803  hypothetical protein  52.08 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.505321  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5888  conserved hypothetical membrane spanning protein  51.79 
 
 
64 aa  52  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0409145  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0307  hypothetical protein  61.29 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2487  hypothetical protein  62.07 
 
 
80 aa  41.2  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.713892  normal  0.311023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>