24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4643 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4643  ISSru3, transposase InsB  100 
 
 
76 aa  161  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104155  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1527  hypothetical protein  86.84 
 
 
76 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3097  hypothetical protein  84.21 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1375  hypothetical protein  84.21 
 
 
76 aa  70.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0430  IS1 transposase  34.21 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.356637 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3100  IS1 transposase  34.21 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2987  IS1 transposase  34.21 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2936  IS1 transposase  34.21 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1673  IS1 transposase  34.21 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.406571 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0805  IS1 transposase  34.21 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.244962  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2795  IS1 transposase  34.21 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2700  IS1 transposase  34.21 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.179766  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2595  IS1 transposase  34.21 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00695571  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2587  IS1 transposase  34.21 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.940725  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2578  IS1 transposase  34.21 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2533  IS1 transposase  34.21 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2446  IS1 transposase  34.21 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.994659  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2436  IS1 transposase  35.06 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2377  IS1 transposase  34.21 
 
 
148 aa  55.8  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2372  IS1 transposase  34.21 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.698246  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0614  IS1 transposase  34.21 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261019  normal  0.286378 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2433  IS1 transposase  34.21 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2383  IS1 transposase  34.21 
 
 
148 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.597317  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0741  IS1 family transposase orfB  38.24 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>