19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1055 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1055  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  140  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0254268 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3880  hypothetical protein  72.22 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0189214 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5377  transposase IS4 family protein  51.67 
 
 
354 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.302051 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0716  hypothetical protein  48.08 
 
 
361 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0881  hypothetical protein  48.08 
 
 
361 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1813  hypothetical protein  48.08 
 
 
361 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1945  hypothetical protein  48.08 
 
 
361 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2895  hypothetical protein  48.08 
 
 
361 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0038  hypothetical protein  48.08 
 
 
361 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1851  hypothetical protein  48.08 
 
 
361 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2440  transposase, IS4  40 
 
 
352 aa  43.5  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1784  transposase, IS4  40 
 
 
352 aa  43.5  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0446  transposase IS4 family protein  43.48 
 
 
354 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.449518 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2910  transposase, IS4  38.64 
 
 
175 aa  40.4  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2912  transposase IS4 family protein  38.64 
 
 
331 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2932  transposase IS4 family protein  38.64 
 
 
331 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2989  transposase IS4 family protein  38.64 
 
 
331 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2834  transposase, IS4  38.64 
 
 
331 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0452405  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2720  transposase, IS4  38.64 
 
 
331 aa  40.4  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>