50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1784 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1784  transposase, IS4  100 
 
 
352 aa  713    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2440  transposase, IS4  100 
 
 
352 aa  713    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2594  hypothetical protein  98.69 
 
 
219 aa  321  9.999999999999999e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00339974  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0716  hypothetical protein  31.99 
 
 
361 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0881  hypothetical protein  31.99 
 
 
361 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1813  hypothetical protein  31.99 
 
 
361 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1945  hypothetical protein  31.99 
 
 
361 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2895  hypothetical protein  31.99 
 
 
361 aa  183  3e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1851  hypothetical protein  31.99 
 
 
361 aa  183  5.0000000000000004e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0038  hypothetical protein  31.99 
 
 
361 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0446  transposase IS4 family protein  36.1 
 
 
354 aa  163  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.449518 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2720  transposase, IS4  39.92 
 
 
331 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828953  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2834  transposase, IS4  39.92 
 
 
331 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0452405  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2989  transposase IS4 family protein  39.92 
 
 
331 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2932  transposase IS4 family protein  39.92 
 
 
331 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2912  transposase IS4 family protein  39.92 
 
 
331 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2721  hypothetical protein  59.75 
 
 
164 aa  159  5e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.477934  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5377  transposase IS4 family protein  35.96 
 
 
354 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.302051 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4489  transposase IS4 family protein  28.93 
 
 
384 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4499  transposase IS4 family protein  28.93 
 
 
384 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4464  transposase IS4 family protein  28.93 
 
 
384 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4536  transposase IS4 family protein  28.93 
 
 
384 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.0600651  normal  0.65428 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4552  transposase IS4 family protein  28.93 
 
 
384 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4514  transposase IS4 family protein  28.93 
 
 
384 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  0.810745  normal  0.887559 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1100  transposase IS4 family protein  28.93 
 
 
384 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1809  transposase IS4 family protein  28.93 
 
 
384 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2048  transposase IS4 family protein  28.93 
 
 
384 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2792  transposase IS4 family protein  28.93 
 
 
384 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3046  transposase IS4 family protein  28.93 
 
 
384 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3398  transposase IS4 family protein  28.93 
 
 
384 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3922  transposase IS4 family protein  28.93 
 
 
384 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4535  transposase IS4 family protein  26.2 
 
 
365 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2052  hypothetical protein  30.87 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2910  transposase, IS4  49.46 
 
 
175 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5057  hypothetical protein  33.09 
 
 
183 aa  77.4  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00408513  normal  0.218379 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0405  transposase IS4 family protein  28.29 
 
 
383 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00559123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0411  transposase IS4 family protein  28.29 
 
 
383 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.215728  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5389  transposase IS4 family protein  24.8 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5516  transposase IS4 family protein  24.8 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.378571 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0444  transposase, IS4 family protein  25.92 
 
 
372 aa  66.2  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000119461  normal  0.0439577 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3880  hypothetical protein  32.14 
 
 
144 aa  63.2  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0189214 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0171  hypothetical protein  25.52 
 
 
257 aa  62.8  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353474  normal  0.731935 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1477  hypothetical protein  37.68 
 
 
77 aa  57  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.64011  normal  0.251804 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4546  hypothetical protein  37.68 
 
 
77 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.143592  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4911  IS4 family transposase  22.64 
 
 
275 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0145672  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1647  hypothetical protein  37.68 
 
 
77 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.158315  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2039  transposase IS4 family protein  23.58 
 
 
378 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3158  transposase, IS4 family protein  25.34 
 
 
416 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0330  hypothetical protein  30.38 
 
 
104 aa  46.6  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1055  hypothetical protein  40 
 
 
68 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0254268 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>